Вспышек обезьяньей оспы может быть по меньшей мере две — к такому выводу пришли генетики, которые отсеквенировали еще несколько вирусных геномов из образцов американских пациентов. Некоторые из этих геномов на филогенетическом дереве оказались ближе к образцам 2021 года, чем 2022-го.

И, хотя в новом кластере пока всего два генома, из этого следует, что вирус может циркулировать в большем числе стран, чем сейчас известно. Геномы новых образцов и их дерево опубликованы на портале nextstrain.org. Оспа обезьян, которой обычно болеют только жители Африки, в мае 2022 года распространилась сразу на несколько континентов: в Европу, Австралию и обе Америки. За месяц с момента обнаружения первого случая число зараженных перевалило за тысячу, причем подавляющее большинство этих людей в последнее время не ездили в Африку. Это означает, что вирус начал передаваться внутри неафриканских популяций. Однако все еще неизвестно, кто вывез вирус из Африки и сколько раз это произошло.

В начале июня португальские генетики сравнили геномы вирусов из португальских образцов с геномами из нескольких других стран. Оказалось, что все они не очень сильно отличаются друг от друга. А ближайшие их родственники — образцы вируса из Нигерии в 2019 году. Эти данные не позволили выяснить, где вирус провел время с 2019 по 2022 год, а также где и от кого (от человека, обезьяны или другого животного-резервуара оспы) заразился нулевой пациент в новой вспышке. Но позволили предположить, что такой пациент был один.

Теперь американские генетики из Центра по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) добавили в базу данных nextstrain.org несколько новых образцов. Среди них были несколько свежих — от пациентов из Флориды и Вирджинии, а также два старых — от людей из Мэриленда и Техаса, которые переболели оспой, приехав из-за границы в 2021 году.

Ученые заметили, что все эти образцы не входят в тот же кластер, что и большинство европейских и американских вирусов оспы. Свежие геномы из Флориды и Вирджинии и геном из Техаса 2021 года сформировали отдельную группу. Их ближайший предок — образец из Нигерии 2017 года. Как рассказала представитель CDC Инджер Дэймон в интервью порталу STAT, эти три человека наверняка заразились за границей. Один из них ездил в Нигерию, второй — в другую страну Западной Африки, третий — в Восточную Африку и на Ближний Восток. К тому же, эти три образца достаточно сильно отличаются друг от друга — поэтому маловероятно, чтобы пациент из Техаса был напрямую связан с двумя новыми случаями. Из этого, по словам Дэймон, следует, что стран, где эндемична обезьянья оспа, может быть больше, чем мы думаем. Может оказаться, что она активно распространяется в других странах Африки и Азии, оставаясь незамеченной для врачей — и недавних завозов оттуда могло быть несколько.

Геном из Мэриленда 2021 года не относится к этому кластеру. Напротив, он оказался сильнее всего похож на предка большого европейского кластера. Это, по мнению экспертов из Nextstrain, может означать, что новая вспышка возникла не из животного резервуара, а от людей, среди которых вирус циркулировал по меньшей мере несколько месяцев.

Генетики также заметили, что во всех новых образцах присутствуют мутации одного типа. Это следы работы противовирусных ферментов в клетках человека. То есть, вероятнее всего, в организме одного или несколько людей ферменты пытались «сломать» вирусный геном и внесли в него случайные изменения. Вирус «выжил», а эти изменения достались по наследству его потомкам. Такие изменения необязательно влияют на свойства вируса. И ученые из других стран уже писали о том, что такого рода мутации составляют большинство изменений в других геномах из новой вспышки.

Новые данные пока не позволяют полностью восстановить картину происхождения вспышки. «Не очень понятно, что все это означает, — сказала Дженнифер МакКуистон, ответственная за реагирование на обезьянью оспу в CDC, на брифинге 3 июня. — Но похоже, что за последнюю пару лет было две точки, в которых вирус оспы обезьян перешел от животного резервуара к людям в Нигерии». Дальше вирус начал распространяться между людьми. И все еще неизвестно, сколько времени и в каких странах эта передача вируса оставалась незамеченной.

https://nplus1.ru/news/2022/06/06/monkeypox-second-outbreak